Yoshihiko Noda describió las islas, conocidas como Senkaku en Japón y Diaoyu en China, como parte inherente del territorio japonés.
Pero añadió que Japón está determinado a resolver este asunto de manera pacífica.
La disputa entre las dos potencias asiáticas se recrudeció en las últimas semanas después de que el gobierno japonés comprara tres de las islas a su propietario privado, un terrateniente japonés.
Taiwán también reclama la soberanía sobre el archipiélago y el pasado martes, decenas de barcos pesqueros taiwaneses irrumpieron brevemente en las aguas que rodean las islas.
Con información de la BBC